《中华胃肠外科杂志》我刊创办于1998年5月，目前是我国惟一的胃肠外科专业学术期刊。本刊的主要读者对象为普通外科和胃肠外科及相关专业临床、科研、教学的高、中级医师。办刊宗旨是：在贯彻执行理论与实践相结合、普及与提高相结合的方针，全面系统地反映国内外胃肠外科领域的学术动态，促进我国胃肠外科的学科发展和学术交流。
《中华胃肠外科杂志》设有专题述评、专题论坛、述评、专家笔谈、专题论著、论著、临床报道、病例报告、临床思维与训练、诊治指南、文献综述、医学信息等栏目；重点刊登胃肠外科及相关学科的主要研究成果和最新进展方面的文章；具有较高的学术权威性和一定的学术导向性。
《中华胃肠外科杂志》于2000年3月被吸收入国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）；2005年3月又被国际上最具权威的生物医学期刊数据库——美国国立图书馆Medline数据库收录；2008年，又被北大图书馆收录为临床医学核心期刊。同时，本刊还是《中国学术期刊（光盘版）》和中国期刊网全文数据库收录期刊，是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；同时被收录为《中国核心期刊（遴选）数据库》，还是《中国生物医学核心期刊》；中文核心期刊(2008)。
CA 化学文摘(美)、国家图书馆馆藏、知网收录(中)、文摘与引文数据库、CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)、上海图书馆馆藏、维普收录(中)、万方收录(中)、统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
中国期刊全文数据库（CJFD）
专题述评、专题论坛、述评、专家笔谈、专题论著、论著、临床报道、病例报告、临床思维与训练、诊治指南、文献综述、医学信息
1． 《中华胃肠外科杂志》文稿应具有科学性和实用性，论点明确、资料可靠、数据准确（必要时应做统计学处理）、文字精炼、重点突出，论著类稿件一般不超过5000字（包括摘要、图、表和参考文献），并附400字左右的中、英文摘要（包括英文文题、工作单位和汉语拼音书写的作者姓名）；短篇论著一般不超过2000字；讲座、综述、会议纪要、临床经验类文稿字数可视情况而定。
2． 《中华胃肠外科杂志》来稿需经作者单位主管学术机构审核，并附单位推荐信。推荐信应注明对稿件的审评意见以及无一稿两投、不涉及保密、署名无争议等项。如涉及保密问题，需附有关部门审查同意发表的证明。 切勿一稿两投，一旦发现一稿两投，将立即退稿；而一旦发现一稿两用，本刊将进行如下处理：
（1）刊登撤销该论文及该文系重复发表的声明，并在中华医学会系列杂志上通报；
（2）向作者所在单位和该领域内的其他科技期刊进行通报；
（3）2年内拒绝发表以该文第一作者为作者的任何来稿。已在非公开发行的刊物上发表，或在学术会议交流过，或已用其他文种发表过（需征得首次刊登期刊的同意）的文稿，不属于一稿两投，但作者在投稿时必须注明。
3． 《中华胃肠外科杂志》当论文的主体是以人为研究对象，涉及医学伦理问题及是否知情同意时，作者应说明其遵循的程序是否符合负责人体试验的委员会（单位性的、地区性的或国家性的）所制订的伦理学标准，并提供该委员会的标准文件及受试对象或其亲属的知情同意书。
4． 要求一律通过“中华医学会稿件远程管理系统”向我刊进行投稿。
5． 论文所涉及的课题若取得国家或部、省级以上基金资助或属攻关项目，请脚注于文题页左下方，如：“基金项目：国家自然科学基金（××××××××）；国家863高技术研究发展计划（××××）”，并请附基金证书复印件。论文刊登后获奖者，请及时通知编辑部，并附获奖证书复印件。
6． 本刊实行以同行审稿为基础的三审制（编辑初审、专家外审、编委会终审）。在投稿时作者须告知与该研究有关的潜在利益冲突（即：是否有经济利益或其他关系造成的利益冲突）。审稿过程中保护作者稿件的私密权。对不拟刊用的稿件将告知退稿意见，对稿件处理有不同意见者，作者有权申请复议，并提出申诉的文字说明。
7． 本刊对重大研究成果，将使用“快速通道”以最快时间发表。凡要求以“快速通道”发表的论文，作者应提供关于论文创新性的书面说明、查新报告和2位高级职称的同行专家（至少有1位为非本单位专家）的推荐信，以说明该项成果的学术价值。作者同时可推荐3～5名审稿专家（需注明其详细联系方法，包括Eｍａｉｌ）供编辑部参考。稿件经审核同意后一般在收稿后4个月内出版。申请进入“快速通道”的稿件需交纳审稿费200~400元。
