《南京农业大学学报》（双月刊）创刊于1956年，是南京农业大学主办的综合性农业科学学术期刊，为自然科学版。主要刊登作物遗传育种、生理生态、栽培与耕作，植物病虫草害防治，生命科学，园艺科学，食品科学，动物医学，动物科学，资源与环境科学，农业应用化学及农业工程等学科的研究论文、实验技术、文献综述、科研简报以及反映最新成果的科技快讯。
《南京农业大学学报》获中国自然科学核心期刊、全国优秀科技期刊、第二届江苏省十佳科技期刊、中国期刊方阵“双效”期刊。
《南京农业大学学报(社科版)》（双月刊）创刊于2001年，是南京农业大学主办、教育部主管的综合性学术理论刊物，在体现学校学科特色的同时，兼顾其他人文学科。
《南京农业大学学报(社科版)》是坚持以马列主义、毛泽东思想和邓小平理论、“三个在代表”的重要思想为指导，传播社会主义先进文化，关注哲学、社会科学的研究成果，特别是我国改革开放和现代化建设事业中带有全局性、战略性、前瞻性的重大问题的研究成果。举凡有关当代国内国际政治、经济、文化、科技、道德、哲学、宗教等的研究论文均在本刊选用之列。获奖情况：2004-2005年，“农村.农民.农业研究”栏目荣获期刊组优秀栏目二等奖；2010年，“全国百强期刊”；被评为“农村.农业.农民”栏目特色栏目；中文核心期刊(2011)。
CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)、知网收录(中)、统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)、维普收录(中)、国家图书馆馆藏、北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)、CA 化学文摘(美)、万方收录(中)、哥白尼索引(波兰)、上海图书馆馆藏、JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
中国核心期刊遴选数据库、全国优秀科技期刊、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国期刊方阵双效期刊、中国科技期刊核心期刊、全国中文核心期刊
研究论文、实验技术、文献综述、科研简报、科研快报
1.《南京农业大学学报》来稿要求与注意事项。
（1）来稿务必论点明确，数据可靠，文字精炼并注意保守国家机密。
（2）文稿内容应包括：题名（避免使用非公知公用的符号），作者(用*标示通讯作者)及工作单位、所在省份及城市、邮政编码，中文摘要（含研究目的、方法、结果、结论，提供论文中全部创新内容和尽可能多的定量或定性的信息。），关键词（3～8个），中图分类号，英文文题，作者姓名（汉语拼音）及单位，英文摘要（内容与中文摘要一致，用第3人称撰写），英文关键词(与中文一致)，正文，致谢，参考文献。篇首页下脚请注明论文受何种基金资助及编号，作者简介包括：姓名，职称，研究方向，E-mail或电话。如第一作者为研究生（标注：姓名，硕士或博士研究生。）需注明导师或通讯作者的详细简介。
（3）文稿中应采用规范化名词术语，首次出现的外文缩写词应同时给出中、英文全称。量名称及符号必须符合国家标准，并采用我国法定计量单位。各层次标题一律用阿拉伯数字左顶格书写，如1，1.1，1.1.1，2，2.1，…，等。请明确字母的正斜体。拉丁文生物学名的属、种名为斜体，定名人为正体，拉丁学名在文中首次出现时不能缩写。基因符号斜体。
（4）图表要精选，设计合理，具有自明性，勿与文字叙述重复。图要求线条均匀，主辅线分明，标注完整；照片要求图像清晰，反差适宜，剪裁得当，并注明放大倍数。表格用三线表。图表内容（包括注释）一律采用中英文对照。
（5）参考文献应选用公开发表的资料，每篇引用10～25篇文献，尽可能引用近10年的文献，其中近5年文献不少于1/2，英文文献不少于1/3。并按引用的顺序在正文中连续编码。
文后参考文献的著录格式如下：
期刊：［序号］责任者.篇名[J].期刊名，年份，卷（期）：起止页
专著：［序号］责任者.书名[M].版次（第1版省略）.
出版地：出版单位，出版年：起止页论文集：［序号］析出文献责任者.篇名[C]//编者.
论文集名.出版地：出版者,出版年：起止页学位论文：［序号］作者.篇名[D].
保存地点：保存单位,年份专利文献：专利申请者.专利题名：专利国别，专利号[P].
公告日期或公开日期(注：作者不超过3人的全部写出，超过3人的只写前3名，后加“，等”或“，etal”；英、美、德、俄等国人名书写时，应姓前名后，名用缩写。)
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